Yu-Gi-Oh! 5D’s Master of the Cards is bedoeld als uitgebreide simulatie van de trading card game, en is zo ontworpen dat er optimaal gebruik wordt gemaakt van het unieke controller systeem van de Wii. De game zal meer dan 4,500 virtuele cards bevatten waarvan de spelers een deck kunnen samenstellen met monsters, vallen, en toverspreuken om te gebruiken tegen ofwel een een cpu-controlled duelists of een online tegenstander.
In de Story Modus van 5D’s Tag Force 5 kunnen spelers elkaar ontmoeten, duelleren en kennis maken met meer dan honderd personages, waaronder de vele bekende gezichten uit de populaire animatie serie. De opdracht van de spelers is om de rust en orde te herstellen in New Domino City en Satellite, nadat Ghost – een mysterieuze Turbo Duelist – en twee andere kwaadaardige bewoners de boel op stelten zetten.