In de 13de hierarchische stad Kagutsuchi, zijn het de Librarium die de enorme krachten van de Armagus, een samensmelting van magie en technologie, beheren. Als het spel begint, zitten ze op de hielen van de gezochte crimineel Ragna, die erop uit is om de Librarium te vernietigen.
Ragna is in het bezit van een krachtige vorm van Armagus, de Azure Grimoire. Hierdoor zijn veel mensen niet alleen uit op het losgeld maar zit men ook achter de Grimoire aan.
BlazBlue: Calamity Trigger is de nieuwe fightinggame afkomstig van de makers van de hitserie Guilty Gear. Net als in Guilty Gear zijn alle personages en animaties handgetekend.